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基于并行化誘導(dǎo)排序快速實(shí)現(xiàn)Burrows-Wheeler 變換算法

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摘要:為解決生物序列比對算法中主流索引技術(shù)Burrows-Wheeler變換(BWT) 構(gòu)建索引效率低的問題,文章提出了一種利用并行化誘導(dǎo)排序改進(jìn)BWT索引構(gòu)建的方法。首先,該研究充分發(fā)揮誘導(dǎo)排序的線性時間復(fù)雜度優(yōu)勢,高效地建立后綴數(shù)組。其次,基于此,采用并行化優(yōu)化算法對后綴類型和子串處理過程進(jìn)行優(yōu)化。(剩余158字)

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