基于稀疏自編碼器的細(xì)胞類(lèi)型反卷積模型SMCTD 設(shè)計(jì)與實(shí)現(xiàn)

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摘要：?jiǎn)渭?xì)胞 RNA 測(cè)序已成為研究生物學(xué)重要特征的強(qiáng)大高分辨率工具。然而，其測(cè)序條件苛刻，價(jià)格成本高昂。目前細(xì)胞類(lèi)型反卷積能夠很好地解決這些限制問(wèn)題，SMCTD（Sparse Model Cell Type Deconvolution） 使用稀疏自編碼器優(yōu)化TAPE（Tissue-AdaPtive autoEncoder） ，使其在直腸癌和PBMC模擬數(shù)據(jù)上預(yù)測(cè)細(xì)胞類(lèi)型比列具有更高的靈敏度、準(zhǔn)確性和整體性能，同時(shí)在預(yù)測(cè)細(xì)胞類(lèi)型特異性基因表達(dá)上表現(xiàn)更優(yōu)。（剩余5525字）