基于稀疏自編碼器的細胞類型反卷積模型SMCTD 設(shè)計與實現(xiàn)

打開文本圖片集

摘要：單細胞 RNA 測序已成為研究生物學(xué)重要特征的強大高分辨率工具。然而，其測序條件苛刻，價格成本高昂。目前細胞類型反卷積能夠很好地解決這些限制問題，SMCTD（Sparse Model Cell Type Deconvolution） 使用稀疏自編碼器優(yōu)化TAPE（Tissue-AdaPtive autoEncoder） ，使其在直腸癌和PBMC模擬數(shù)據(jù)上預(yù)測細胞類型比列具有更高的靈敏度、準(zhǔn)確性和整體性能，同時在預(yù)測細胞類型特異性基因表達上表現(xiàn)更優(yōu)。（剩余5525字）