玉米乙烯響應(yīng)因子亞家族的生物信息學(xué)鑒定與分析

打開文本圖片集

摘要： 為了全面了解玉米APETALA2/乙烯響應(yīng)因子（AP2/ERF）超家族中ERF亞家族成員在玉米生長發(fā)育和逆境過程中的作用， 利用生物信息學(xué)手段鑒定和分析玉米Zea mays L.B73基因組ERF亞家族成員。 結(jié)果表明： 共鑒定到87個ERF基因且不均勻地分布在玉米的10條染色體上， 蛋白序列長度為124～603 aa， 蛋白質(zhì)分子質(zhì)量為13.23～65.44 kDa， 理論等電點為4.44～10.84， 亞細(xì)胞定位于細(xì)胞核； 進(jìn)化樹分析顯示，ERF基因被分為5個組， 各組內(nèi)的基因結(jié)構(gòu)和保守基序的數(shù)量、 分布等相似， 但各組之間存在較大的差異， 多數(shù)沒有內(nèi)含子， 有內(nèi)含子的基因占比為20.69%； ERF亞家族成員共有10個保守基序， 其中前2個保守基序最為保守， 且通常以串聯(lián)方式存在于多數(shù)ERF亞家族成員中； 啟動子分析顯示ZmERF基因含有大量光響應(yīng)、 激素響應(yīng)、 脅迫響應(yīng)和生長發(fā)育相關(guān)元件， 表明玉米ERF亞家族成員在玉米生長發(fā)育及非生物脅迫、 生物脅迫方面發(fā)揮作用。（剩余21211字）