1 且FDR <0.05 的篩選標(biāo)準(zhǔn)得到差異表達(dá)基因，并針對(duì)差異表達(dá)基因進(jìn)行GO功能和KEGG通路富集分析，并通過熒光定量來檢測(cè)肝組織中與膽汁酸代謝和免疫功能相關(guān)基因的表達(dá)量。采用試劑盒檢測(cè)肝中免疫指標(biāo)（IgA、IgG、IgM,C3,C4) 含量。免疫指標(biāo)結(jié)果顯示：試驗(yàn)I組的肝 IgA,IgG,C3 含量顯著高于對(duì)照組（ ?P<0. 05) 。測(cè)序結(jié)果顯示：各組間兩兩比較獲得915個(gè)差異表達(dá)基因(DEGs)，與對(duì)照組相比，試驗(yàn)I組和試驗(yàn)Ⅱ組分別各有237和270個(gè)上調(diào)基因以及78和106個(gè)下調(diào)基因。其中，GO功能注釋的結(jié)果顯示，差異表達(dá)基因主要富集在病毒防御調(diào)控、免疫和激素調(diào)節(jié)與生物合成相關(guān)的GO條目上。KEGG富集分析結(jié)果顯示，與對(duì)照組相比，試驗(yàn)I組主要富集在膽固醇合成、花生四烯酸代謝等與生物過程和代謝途徑相關(guān)的通路，其中通路中多數(shù)基因顯著上調(diào)。隨著中草藥飼料添加劑劑量的進(jìn)一步升高，試驗(yàn)Ⅱ組的DEGs更多地富集到谷胱甘肽、咖啡因代謝等代謝相關(guān)的通路。通過對(duì)膽汁酸代謝相關(guān)基因(FXR、UGT2B18、ABCC4、UGT1A6、CYP7A1、HMGCR、SHP、FGFR4、GPBAR1、HSL）和免疫相關(guān)基因 (LOC101119773,MAPK4,XAF1,AHR 、TLR2、TLR4、IL-16)進(jìn)行RT-qPCR驗(yàn)證發(fā)現(xiàn)， ?SHP 、FXR基因在試驗(yàn)I組表達(dá)顯著高于對(duì)照（ ?P<0.05 ），而FGFR4、CYP7A1、GPBAR1、ABCB11、HSL基因在試驗(yàn)I組表達(dá)呈上升趨勢(shì)，但與對(duì)照組差異不顯著 (P>0.05 ）。 LOC101119773,MAPK4,XAF1,AHR,TLR4,TLR2 ，IL-16基因在試驗(yàn)I組顯著高于對(duì)照組 (P<0.05) 。結(jié)果提示，中草藥飼料添加劑可促進(jìn)湖羊肝的膽汁酸合成和分泌，增強(qiáng)-龍?jiān)雌诳W(wǎng)" />

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肝轉(zhuǎn)錄組揭示中草藥飼料添加劑可能影響湖羊肝組織膽汁酸代謝和免疫功能

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中圖分類號(hào)：S853.75；S826.5 文獻(xiàn)標(biāo)志碼：A 文章編號(hào)：0366-6964（2025）06-3014-13

Transcriptomics Reveals the Effects of Chinese Herbal Feed Additives on Bile Acids Metabol（剩余21548字）

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