蓖麻bZIP基因家族的全基因組鑒定、生物信息學(xué)及表達(dá)分析

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摘要  為了解蓖麻bZIP基因家族成員的組成和家族進(jìn)化關(guān)系及特征，本研究利用生物信息學(xué)鑒定家族成員，進(jìn)行基因結(jié)構(gòu)、蛋白質(zhì)保守基序分析及系統(tǒng)發(fā)育分析，同時(shí)分析其蛋白的理化性質(zhì)、磷酸化位點(diǎn)和互作關(guān)系，以及該基因在組織中的表達(dá)模式和表達(dá)量。結(jié)果表明，共鑒定出46個(gè)蓖麻bZIP基因家族成員，位于10個(gè)染色體上；基因結(jié)構(gòu)與蛋白質(zhì)保守基序較為復(fù)雜，可分為11個(gè)亞族，包含25個(gè)基序；與擬南芥進(jìn)化相似，較為保守；bZIP蛋白為親水性蛋白，位于細(xì)胞核、細(xì)胞膜和葉綠體，主要通過(guò)絲氨酸的磷酸化來(lái)發(fā)揮生物學(xué)作用，蛋白R(shí)cbZIP18、RcbZIP27、RcbZIP2、RcbZIP17和RcbZIP46之間的聯(lián)系較多，通過(guò)蛋白間的相互作用參與蓖麻各個(gè)生長(zhǎng)時(shí)期；該基因家族均參與葉、莖、根和胚等生長(zhǎng)時(shí)期的發(fā)育調(diào)控，其中RcbZIP10、RcbZIP25和RcbZIP44在葉片和種子中表現(xiàn)出明顯的組織差異性。（剩余12270字）