基于Cytb基因的穿山甲科物種鑒定研究

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摘要 為鑒別混有非穿山甲物種疑似檢材的來源物種，基于細(xì)胞色素b基因設(shè)計(jì)了穿山甲科特異的新引物 DCW-F1/DCW-R1。試驗(yàn)表明：其特異性良好、靈敏度較高、適用檢材類型較廣。采用BLAST比對(duì)法、遺傳距離法和系統(tǒng)發(fā)育法分析了4組不同長(zhǎng)度Cytb序列，研究序列長(zhǎng)度對(duì)穿山甲物種鑒定的影響。結(jié)果表明，多數(shù)樣本與相應(yīng)穿山甲物種同源序列相似度均高于98%，建議將該值作為BLAST比對(duì)法的判別標(biāo)準(zhǔn)；除馬來穿山甲（211 bp）和樹穿山甲（421和 211 bp）外，剩余5個(gè)穿山甲物種種間最小遺傳距離均大于種內(nèi)最大遺傳距離，序列長(zhǎng)度的變化和樣本量的不平衡會(huì)導(dǎo)致該比值不穩(wěn)定；除馬來穿山甲和菲律賓穿山甲，其余物種均為單系，序列長(zhǎng)度變短使得系統(tǒng)發(fā)育樹拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)和分支置信度發(fā)生相應(yīng)變化。（剩余15535字）