基于轉(zhuǎn)錄組分析的甘薯貯藏根淀粉含量相關(guān)SNPs開發(fā)

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摘要：甘薯是重要的糧食和經(jīng)濟(jì)作物，貯藏根淀粉含量是甘薯的重要農(nóng)藝性狀，開發(fā)與淀粉含量相關(guān)的分子標(biāo)記對(duì)于加快育種進(jìn)程具有重要意義。但甘薯具有自交不親和特性，基因組是高度雜合的六倍體，增加了開發(fā)分子標(biāo)記的難度。本試驗(yàn)以高淀粉品種漯徐薯8號(hào)和低淀粉品種鄭薯20及其雜交F1代中6個(gè)高淀粉株系和6個(gè)低淀粉株系為材料，基于轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析并結(jié)合表型分析，發(fā)現(xiàn)44個(gè)高淀粉特異的SNPs位點(diǎn)，從中選取9個(gè)進(jìn)行PCR單克隆分析，篩選到3個(gè)與高淀粉含量顯著相關(guān)的位點(diǎn)，分別為chr9.27120209、chr9.27120256和chr9.13675504，用上述12個(gè)株系和F1群體中的另外16個(gè)株系進(jìn)行驗(yàn)證，最終得到3個(gè)與貯藏根淀粉含量相關(guān)的單核苷酸多態(tài)性（SNPs）位點(diǎn)。（剩余4427字）