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18種觀賞植物F3′5′H基因生物信息學(xué)分析

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摘要 采用生物信息學(xué)方法對18種觀賞植物類黃酮-3′5′-羥化酶基因(flavonoid-3′5′-hydroxylase,F(xiàn)3′5′H)的mRNA和氨基酸序列的理化性質(zhì)、跨膜結(jié)構(gòu)域、保守結(jié)構(gòu)域、亞細(xì)胞定位、二級結(jié)構(gòu)、三級結(jié)構(gòu)和同源性進(jìn)行預(yù)測與分析。結(jié)果表明,絕大多數(shù)觀賞植物的F3′5′H為親水性穩(wěn)定蛋白質(zhì),以α 螺旋為主、無信號肽的跨膜蛋白質(zhì);大多數(shù)定位于內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜上;其三級結(jié)構(gòu)模型為5ylw.1.A 鐵銹醇合成酶,為單鏈蛋白,屬于細(xì)胞色素P450基因家族;同源保守氨基酸序列為“LPPGP”“AGTDTS”和“PFGAGRRICAG”。(剩余11042字)

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