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利用Transformer的組合聚類算法在蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)分析中的應(yīng)用

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摘要:該研究將Transformer模型適配于蛋白質(zhì)特征降維場(chǎng)景,通過(guò)其特有的自注意力機(jī)制,賦予模型對(duì)長(zhǎng)程依賴關(guān)系的較好建模性能,同時(shí),多頭注意力設(shè)計(jì)使得模型能夠從不同角度捕獲特征間的相互作用,進(jìn)一步提升降維結(jié)果的表達(dá)力和魯棒性。文章提出了一種新型的GRKM組合聚類算法,在原始K-means算法中引入了灰狼優(yōu)化算法(Grey Wolf Optimization Algorithm)確定聚類的K值,以隨機(jī)游走算法(Random Walk)確定初始聚類中心,以馬氏距離(Markov Distance)來(lái)衡量樣本間的相似性。(剩余12175字)

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