決明苯丙氨酸解氨酶（PAL）基因家族的全基因組分析

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摘要：利用HMMER、Pfam與SMART等工具，從決明（Senna tora）等不同物種中篩選獲得26條PAL（苯丙氨酸解氨酶）序列，并對其進行生物信息學(xué)分析。結(jié)果表明，決明PAL基因家族的基本特征在單雙子葉植物分離之前就已形成，且6個PAL成員被分為3個亞類。決明PAL基因家族成員的二級結(jié)構(gòu)主要由α-螺旋和無規(guī)則卷曲組成；含有較高的Ala、Ser和Leu殘基；存在16種不同的保守基序，其中motif12（含有催化關(guān)鍵序列Ala-Ser-Gly）在所有PAL成員中均出現(xiàn)；啟動子區(qū)含有較多的光反應(yīng)、植物激素響應(yīng)與逆境脅迫響應(yīng)元件。（剩余12164字）