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摘要:利用HMMER、Pfam與SMART等工具,從決明(Senna tora)等不同物種中篩選獲得26條PAL(苯丙氨酸解氨酶)序列,并對其進(jìn)行生物信息學(xué)分析。結(jié)果表明,決明PAL基因家族的基本特征在單雙子葉植物分離之前就已形成,且6個(gè)PAL成員被分為3個(gè)亞類。決明PAL基因家族成員的二級結(jié)構(gòu)主要由α-螺旋和無規(guī)則卷曲組成;含有較高的Ala、Ser和Leu殘基;存在16種不同的保守基序,其中motif12(含有催化關(guān)鍵序列Ala-Ser-Gly)在所有PAL成員中均出現(xiàn);啟動(dòng)子區(qū)含有較多的光反應(yīng)、植物激素響應(yīng)與逆境脅迫響應(yīng)元件。(剩余12164字)
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決明苯丙氨酸解氨酶(PAL)基因家族的全基因組分析
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