世界首個番茄超泛基因組構建完成
4月6日,由新疆農(nóng)業(yè)科學院加工番茄生物育種創(chuàng)新團隊牽頭,聯(lián)合中國農(nóng)業(yè)科學院等多家單位,在國際學術期刊《自然·遺傳》在線發(fā)表了題為《超泛基因組研究揭示野生和栽培番茄物種基因組和結構變異多樣性》的科研成果。
該團隊研究收集了8個野生番茄種、1個番茄近源野生種和2個栽培番茄代表性品種,利用PacBio(第三代單分子實時測序技術)、Bionano(全基因組光學圖譜技術)和Hi-C(高通量染色體構象捕獲技術)測序技術,組裝了11個染色體水平高質(zhì)量基因組,解析了番茄屬基因組特征,重構了番茄屬系統(tǒng)發(fā)生關系,構建了國際首個番茄超泛基因組,為群體水平SV基因分型提供了強大的平臺,這將有助于開發(fā)風味改良番茄品種育種的標記。(剩余0字)