基于簡化基因組測序評估小骨山羊群體遺傳多樣性和群體結(jié)構(gòu)

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摘 要： 旨在分析小骨山羊群體的遺傳多樣性，為明確其是否為新種質(zhì)資源提供理論依據(jù)。本研究以小骨山羊、河西絨山羊和內(nèi)蒙古絨山羊（阿爾巴斯型）為研究對象，每個(gè)群體選取20只成年健康母羊，使用SLAF-seq技術(shù)檢測全基因組范圍內(nèi)核苷酸多態(tài)性（SNPs）。遺傳多樣性通過使用perl編程計(jì)算次要等位基因頻率（MAF）、觀測雜合度（Ho）、期望雜合度（He）、基因多樣性指數(shù)（Nei）、多態(tài)信息含量（PIC）和香濃維納指數(shù)（SHI）；使用PopLDdecay進(jìn)行連鎖不平衡分析（LD）；使用VCFtools計(jì)算群體分化指數(shù)（Fst）。（剩余17693字）