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豬源大腸桿菌高致病性毒力島結(jié)構(gòu)基因進化分析及其對TNF/NF-κB通路的影響

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摘 要: 旨在研究豬源大腸桿菌(Escherichia coli,E. coli)高致病性毒力島(high pathogenicity island,HPI)結(jié)構(gòu)基因的進化趨勢及其對TNF/NF-κB通路的影響。本研究運用MEGA等軟件分析HPI結(jié)構(gòu)基因的遺傳進化,使用R語言功能包挖掘E.coli感染細胞的基因表達綜合數(shù)據(jù)庫(gene expression omnibus,GEO),并進行差異基因富集分析;使用分子對接預(yù)測HPI-Ybt與TNF/NF-κB通路相關(guān)蛋白的結(jié)合;將E. coli及前期構(gòu)建的HPI缺陷株E.coliΔHPI感染IPEC-J2細胞,運用qPCR、ELISA和Western blot對TNF/NF-κB通路中的關(guān)鍵調(diào)控點進行檢測。(剩余15000字)

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