轉(zhuǎn)錄組測序篩選牛卵泡發(fā)育偏差和優(yōu)勢卵泡選擇相關(guān)基因

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摘 要: 旨在篩選牛卵泡發(fā)育偏差和優(yōu)勢卵泡(dominant follicle, DF)選擇相關(guān)基因。本研究選取6頭10月齡健康海福特青年母牛,同期發(fā)情后平均分為兩組,第一組采集第一個卵泡發(fā)育波出現(xiàn)偏差前第一大卵泡(the largest follicle at predeviation, PDF1)和第二大卵泡(the second largest follicle at predeviation, PDF2),第二組采集第一個卵泡發(fā)育波出現(xiàn)偏差后第一大卵泡(the largest follicle at onset of deviation, ODF1)和第二大卵泡(the second largest follicle at onset of deviation, ODF2),提取卵泡顆粒細胞(granule cells, GCs)RNA進行轉(zhuǎn)錄組測序,測序結(jié)果對照參考基因組,PDF1-VS-PDF2組篩選影響卵泡發(fā)育偏差的差異表達基因(differentially expressed genes, DEGs),ODF1-VS-ODF2組、ODF1-VS-PDF1組和ODF1-VS-PDF2組篩選影響優(yōu)勢卵泡選擇的DEGs并進行GO和KEGG富集分析、PPI分析篩選關(guān)鍵基因,通過RT-qPCR和Western blotting驗證篩選基因的準確性。(剩余20794字)