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肝細胞癌預后、診斷和免疫細胞浸潤相關關鍵基因及其潛在治療藥物的生物信息學分析

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[摘 要] 目的:利用生物信息學分析方法篩選與肝細胞癌 (HCC) 患者預后、診斷和免疫細胞浸潤相關的關鍵基因,并分析其潛在治療藥物。方法:從基因表達匯編(GEO)數(shù)據(jù)庫和癌癥基因組圖譜(TCGA) 數(shù)據(jù)庫下載HCC 基因表達譜數(shù)據(jù)及相應的HCC 患者臨床信息。采用R 軟件limma 包篩選HCC 差異表達基因(DEGs),對DEGs 進行基因本體論(GO) 功能和京都基因與基因組百科全書(KEGG) 信號通路富集分析,利用STRING 數(shù)據(jù)庫構建蛋白-蛋白互作(PPI) 網(wǎng)絡,使用 Cytoscape軟件對PPI 網(wǎng)絡進行可視化并篩選關鍵基因。(剩余16615字)

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