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基于泛基因組學和消減蛋白質組學技術篩選金黃色葡萄球菌基于泛基因組學和消減蛋白質組學技術篩選金黃色葡萄球菌

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[摘 要] 目的:應用泛基因組學和消減蛋白質組學技術從金黃色葡萄球菌基因組中篩選新抗菌靶點,為抗金黃色葡萄球菌藥物的研發(fā)奠定基礎。方法:在美國國家生物技術信息中心 (NCBI) 數(shù)據庫中以金黃色葡萄球菌為關鍵詞檢索全基因組測序數(shù)據,收集50 個測序級別為Complete 的菌株基因組數(shù)據。采用BPGA 工具對基因組數(shù)據進行泛基因組分析獲得金黃色葡萄球菌核心基因,采用消減蛋白質組學技術從中篩選獲得潛在抗菌靶點, 以潛在抗菌靶點為受體, 采用LibDock 軟件從美國食品藥品監(jiān)督管理局(FDA) 批準的藥物庫中篩選潛在的抗金黃色葡萄球菌藥物,并采用分子對接技術分析藥物和靶點的結合能力。(剩余12961字)

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