基于泛基因組學(xué)和消減蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)篩選金黃色葡萄球菌基于泛基因組學(xué)和消減蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)篩選金黃色葡萄球菌

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［摘 要］ 目的：應(yīng)用泛基因組學(xué)和消減蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)從金黃色葡萄球菌基因組中篩選新抗菌靶點(diǎn)，為抗金黃色葡萄球菌藥物的研發(fā)奠定基礎(chǔ)。方法：在美國(guó)國(guó)家生物技術(shù)信息中心 （NCBI） 數(shù)據(jù)庫(kù)中以金黃色葡萄球菌為關(guān)鍵詞檢索全基因組測(cè)序數(shù)據(jù)，收集50 個(gè)測(cè)序級(jí)別為Complete 的菌株基因組數(shù)據(jù)。采用BPGA 工具對(duì)基因組數(shù)據(jù)進(jìn)行泛基因組分析獲得金黃色葡萄球菌核心基因，采用消減蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)從中篩選獲得潛在抗菌靶點(diǎn)， 以潛在抗菌靶點(diǎn)為受體， 采用LibDock 軟件從美國(guó)食品藥品監(jiān)督管理局（FDA） 批準(zhǔn)的藥物庫(kù)中篩選潛在的抗金黃色葡萄球菌藥物，并采用分子對(duì)接技術(shù)分析藥物和靶點(diǎn)的結(jié)合能力。（剩余12961字）