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板藍(lán)與葡萄、漾濞槭基因組的共線性分析

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摘 要 板藍(lán)(Strobilanthes cusia)具有極高的藥用價(jià)值,全草可入藥,是中草藥南板藍(lán)根的主要成分。為了厘清板藍(lán)基因組的進(jìn)化歷程,探究板藍(lán)的生物學(xué)功能,通過(guò)將板藍(lán)基因組與葡萄(Vitis vinifera)、漾濞槭(Acer yangbiense)基因組進(jìn)行全基因組比對(duì),采用推斷基因組同源性、同義堿基替換、Ks的核函數(shù)分析、鑒定染色體的直系和旁系同源區(qū)域、全基因組與局部比對(duì)等方法,發(fā)現(xiàn)板藍(lán)在經(jīng)歷了核心真雙子葉共享的三倍化事件后,還額外經(jīng)歷了一次三倍化事件,并且確定時(shí)間節(jié)點(diǎn)在106~120個(gè)百萬(wàn)年前。(剩余8360字)

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