紫葉苔(Pleurozia purpurea)線粒體基因組密碼子偏好性分析

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摘 要：為了豐富對紫葉苔屬遺傳基礎(chǔ)的認(rèn)識，探究了紫葉苔（Pleurozia purpurea）線粒體基因組密碼子使用的偏好性及其影響因素。首先，基于完整紫葉苔線粒體基因組篩選蛋白編碼序列；然后，利用CodonW、EMBOSS explorer計算各基因的GC含量、有效密碼子數(shù)（ENC）、密碼子適應(yīng)指數(shù)（CAI）和同義密碼子相對使用度（RSCU）等指標(biāo)；最后，采用R軟件進行參數(shù)間的相關(guān)性分析并繪圖。（剩余18346字）