基于生物信息學(xué)探究帕金森病miRNA-mRNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)及作用機(jī)制

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［摘要］  目的： 通過(guò)生物信息學(xué)分析及臨床試驗(yàn)，研究帕金森?。≒arkinson′s disease，PD）發(fā)病過(guò)程中關(guān)鍵的miRNA及mRNA，識(shí)別具有診斷和治療潛力的mRNA與miRNA。方法： 使用來(lái)自帕金森進(jìn)展標(biāo)志物計(jì)劃（Parkinson′s progression markers initiative，PPMI）的mRNA和miRNA測(cè)序數(shù)據(jù)，分析兩者的差異表達(dá)基因，通過(guò)機(jī)器學(xué)習(xí)確定關(guān)鍵miRNA，使用多個(gè)miRNA-mRNA互作數(shù)據(jù)庫(kù)數(shù)據(jù)預(yù)測(cè)靶基因，再將預(yù)測(cè)的靶基因與差異表達(dá)mRNAs進(jìn)行交叉匹配，獲得miRNA-mRNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)；然后利用STRING數(shù)據(jù)庫(kù)和Cytoscape軟件構(gòu)建蛋白質(zhì)相互作用（PPI）網(wǎng)絡(luò)，并篩選出Hub基因；最后通過(guò)實(shí)時(shí)熒光定量PCR（qRT-PCR）在臨床樣本中對(duì)識(shí)別出的Hub基因和miRNA進(jìn)行驗(yàn)證。（剩余12485字）