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基于單細(xì)胞測序探究去勢抵抗性前列腺癌腫瘤微環(huán)境及細(xì)胞間通訊相關(guān)信號分子

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[摘要]目的:探究去勢抵抗性前列腺癌(castration-resistant prostate cancer,CRPC)的腫瘤微環(huán)境中相關(guān)信號分子,并分析其與腫瘤發(fā)生發(fā)展之間的關(guān)系。方法:通過基因表達(dá)綜合數(shù)據(jù)庫(Gene Expression Omnibus,GEO)中CRPC患者的單細(xì)胞RNA測序(scRNA-seq)數(shù)據(jù)(GSE137829),分析CRPC腫瘤微環(huán)境的主要組成成分;通過CellPhoneDB分析微環(huán)境中不同細(xì)胞間的相互作用,重點揭示腫瘤相關(guān)成纖維細(xì)胞(cancer-associated fibroblasts,CAFs)與惡性上皮細(xì)胞之間的聯(lián)系;應(yīng)用CellChat分析CAFs與惡性上皮細(xì)胞通訊相關(guān)的信號分子,結(jié)合腫瘤基因組圖譜前列腺癌(TCGA-PRAD)的數(shù)據(jù),尋找與CRPC患者預(yù)后密切相關(guān)的信號分子。(剩余18170字)

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