杜梨葉片轉(zhuǎn)錄組分析

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摘要：杜梨（Pyrus betulifolia Bunge）抗逆性強(qiáng)，葉色隨季節(jié)變化而改變，被廣泛用于沿海灘涂景觀改造，是園林綠化中常用樹種。為了解杜梨色葉相關(guān)基因調(diào)控途徑，對杜梨葉片進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序，共獲得67.7 Gb測序數(shù)據(jù)，通過組裝共得到60 611個基因，其中包含1 059個新基因;與8個功能數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比對分析，共57 669個基因得到了功能注釋，注釋效率為95.15%;GO分析發(fā)現(xiàn)，已注釋的差異表達(dá)基因共涉及49個功能組，主要集中在膜（細(xì)胞組分）、催化活性（分子功能）、代謝過程（生物學(xué)過程）等中;KEGG分析發(fā)現(xiàn)，差異表達(dá)基因主要富集在碳代謝和植物-病原體相互作用等生物學(xué)過程中;共篩選出10個與類黃酮相關(guān)的基因，分別屬于UDPGT等6個基因家族;在杜梨葉片轉(zhuǎn)錄組中共篩選出452 501個SNP位點(diǎn)，堿基轉(zhuǎn)換類型所占比例遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于顛換類型，表明杜梨具有豐富的SNP位點(diǎn)信息。（剩余9890字）