無乳鏈球菌與小鼠巨噬細(xì)胞互作轉(zhuǎn)錄組測序分析

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摘要 巨噬細(xì)胞是先天性免疫系統(tǒng)的重要組成部分,但無乳鏈球菌(Streptococcus agalactiae)卻能在巨噬細(xì)胞內(nèi)存活并以巨噬細(xì)胞為載體入侵中樞神經(jīng)系統(tǒng)。為解析無乳鏈球菌在巨噬細(xì)胞內(nèi)的存活機制,將無乳鏈球菌HN016 與RAW264.7 共孵育,提取胞內(nèi)細(xì)菌RNA 后進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序(RNA-seq)、Gene Ontology(GO)及Kyotoencyclopedia of genes and genomes(KEGG)富集分析;于體外將HN016 與羅非魚原代巨噬細(xì)胞孵育,提取胞內(nèi)細(xì)菌RNA,并利用quantitative real-time PCR(qPCR)驗證目標(biāo)基因(包括:sip、fbsA、cylB、cylD、cylE、neuA、cpsB 和cfb)表達(dá)情況。(剩余13613字)