棉花種間雜種F1纖維中關(guān)鍵代謝路徑和基因鑒定

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摘要 為在表型和遺傳上揭示遠(yuǎn)緣雜種F1纖維的雜種優(yōu)勢(shì)并解析產(chǎn)量性狀雜種優(yōu)勢(shì)不明顯的原因，分別對(duì)遠(yuǎn)緣雜種F1與陸地棉親本發(fā)育10 d 的纖維組織樣品進(jìn)行混池取樣，利用轉(zhuǎn)錄組學(xué)解析材料間在遺傳轉(zhuǎn)錄水平上的差異，采用生物信息學(xué)方法鑒定材料間存在明顯差異的代謝路徑和關(guān)鍵基因。結(jié)果顯示，雜種F1長(zhǎng)纖維細(xì)胞數(shù)量少，并且種子表面有綠色短絨；陸地棉親本和遠(yuǎn)緣雜種F1纖維轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)共鑒定到1 128 個(gè)上調(diào)基因，678 個(gè)下調(diào)基因；通過(guò)基因富集分析發(fā)現(xiàn)，差異基因主要富集在苯丙烷生物合成及其分支類黃酮生物合成路徑；差異基因的偏親表達(dá)分析顯示，雜種F1纖維等位基因偏向海島棉表達(dá)，其中雜種F1的類黃酮代謝路徑的二氫黃酮醇-3′， 5′-羥化酶（F3′5′H）基因只表達(dá)海島棉的等位基因。（剩余16386字）