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OASL基因在低級別膠質(zhì)瘤中的表達及臨床意義

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摘要  目的:尋找新的對低級別膠質(zhì)瘤(LGG)具有判斷預后作用的標志物和治療靶點,研究2'-5'寡聚腺苷酸合成酶L(OASL)基因在LGG中的表達及其對LGG預后的影響。方法:從癌癥基因組圖譜數(shù)據(jù)庫(TCGA)數(shù)據(jù)庫下載LGG的轉(zhuǎn)錄和臨床數(shù)據(jù),并對微環(huán)境進行生存分析和臨床相關性分析;通過基因本體(GO)和京都基因與基因組百科全書(KEGG)富集分析研究基因功能;篩選獲得預后相關核心基因,聯(lián)合基因型-組織表達數(shù)據(jù)庫(GTEx)數(shù)據(jù)庫對OASL基因進行單基因臨床相關性分析,然后進行基因集富集分析;采用免疫細胞浸潤分析OASL基因與主要免疫細胞的關系;利用Spearmen相關性分析研究OASL基因與DNA甲基化、腫瘤蛋白p53(TP53)、異檸檬酸脫氫酶1(IDH1)、O6-甲基鳥嘌呤-DNA甲基轉(zhuǎn)移酶(MGMT)、絲氨酸/蘇氨酸激酶(BRAF)基因的關系;通過人類蛋白圖譜數(shù)據(jù)庫(HPA)及細胞實驗驗證人類蛋白圖譜數(shù)據(jù)庫與膠質(zhì)瘤的關系。(剩余11514字)

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