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摘要 目的:尋找新的對(duì)低級(jí)別膠質(zhì)瘤(LGG)具有判斷預(yù)后作用的標(biāo)志物和治療靶點(diǎn),研究2'-5'寡聚腺苷酸合成酶L(OASL)基因在LGG中的表達(dá)及其對(duì)LGG預(yù)后的影響。方法:從癌癥基因組圖譜數(shù)據(jù)庫(kù)(TCGA)數(shù)據(jù)庫(kù)下載LGG的轉(zhuǎn)錄和臨床數(shù)據(jù),并對(duì)微環(huán)境進(jìn)行生存分析和臨床相關(guān)性分析;通過基因本體(GO)和京都基因與基因組百科全書(KEGG)富集分析研究基因功能;篩選獲得預(yù)后相關(guān)核心基因,聯(lián)合基因型-組織表達(dá)數(shù)據(jù)庫(kù)(GTEx)數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)OASL基因進(jìn)行單基因臨床相關(guān)性分析,然后進(jìn)行基因集富集分析;采用免疫細(xì)胞浸潤(rùn)分析OASL基因與主要免疫細(xì)胞的關(guān)系;利用Spearmen相關(guān)性分析研究OASL基因與DNA甲基化、腫瘤蛋白p53(TP53)、異檸檬酸脫氫酶1(IDH1)、O6-甲基鳥嘌呤-DNA甲基轉(zhuǎn)移酶(MGMT)、絲氨酸/蘇氨酸激酶(BRAF)基因的關(guān)系;通過人類蛋白圖譜數(shù)據(jù)庫(kù)(HPA)及細(xì)胞實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證人類蛋白圖譜數(shù)據(jù)庫(kù)與膠質(zhì)瘤的關(guān)系。(剩余11514字)
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OASL基因在低級(jí)別膠質(zhì)瘤中的表達(dá)及臨床意義
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