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基于人類(lèi)蛋白質(zhì)組微陣列數(shù)據(jù)篩選蟾毒靈抗癌作用靶點(diǎn)的生物信息學(xué)分析

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[摘要] 目的

通過(guò)生物信息學(xué)方法分析蟾毒靈人類(lèi)蛋白質(zhì)組微陣列數(shù)據(jù),探究蟾毒靈互作蛋白之間的潛在聯(lián)系,預(yù)測(cè)蟾毒靈在癌癥中的作用靶點(diǎn)。

方法 使用clusterProfiler包進(jìn)行GO、KEGG和GSEA富集分析,使用STRING數(shù)據(jù)庫(kù)及Cytoscape軟件進(jìn)行關(guān)鍵蛋白篩選。下載TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)數(shù)據(jù)進(jìn)行關(guān)鍵基因的泛癌分析;使用survival包繪制關(guān)鍵基因在肺癌、肝癌和胃癌中的K-M曲線,評(píng)估其預(yù)后效能。(剩余15957字)

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