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脆蜜金柑果肉轉(zhuǎn)錄組SSR分布及其序列特征分析

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摘要:【目的】分析脆蜜金柑果肉轉(zhuǎn)錄組中簡(jiǎn)單重復(fù)序列(SSR)的分布情況及序列特征,為金柑屬的遺傳多樣性分析、SSR分子標(biāo)記開發(fā)及分子輔助育種等提供參考依據(jù)。【方法】以脆蜜金柑為試驗(yàn)材料,通過(guò)DNBSEQ-G99高通量測(cè)序平臺(tái)對(duì)其果肉組織進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,高質(zhì)量測(cè)序數(shù)據(jù)經(jīng)嚴(yán)格過(guò)濾、拼接及組裝后,使用MISA對(duì)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序得到的Unigenes進(jìn)行SSR位點(diǎn)檢索,并分析其分布情況及序列特征。(剩余24411字)

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