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基于轉(zhuǎn)錄組測序的紅肉火龍果淀粉降解相關(guān)基因挖掘及表達(dá)分析

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摘要:【目的】挖掘紅肉火龍果淀粉降解相關(guān)基因并分析其在果實(shí)不同發(fā)育時(shí)期的表達(dá)模式,為闡明紅肉火龍果果實(shí)成熟過程中的淀粉降解途徑提供理論依據(jù)?!痉椒ā抗┰嚰t肉火龍果品種為軟枝大紅,選取4個(gè)不同發(fā)育時(shí)期(花后19 d、花后22 d、花后25 d和花后28 d)果實(shí)進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序,以差異倍數(shù)(Fold Change)≥2且錯(cuò)誤發(fā)現(xiàn)率(FDR)<0.01為標(biāo)準(zhǔn),篩選不同發(fā)育時(shí)期果實(shí)間的差異表達(dá)基因(DEGs),進(jìn)行GO功能注釋和KEGG信號通路富集分析,通過實(shí)時(shí)熒光定量PCR驗(yàn)證轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)的可靠性并分析候選基因的表達(dá)模式。(剩余20633字)

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