甜瓜GRAS家族全基因組的鑒定與表達(dá)分析

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摘要：為了研究甜瓜（Cucumis melo L.）GRAS基因家族的結(jié)構(gòu)特征、進(jìn)化模式和生長(zhǎng)發(fā)育過(guò)程中的表達(dá)模式，對(duì)甜瓜GRAS全基因組的基本信息、染色體位置、共線性、系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)、基因結(jié)構(gòu)、表達(dá)模式、順式元件進(jìn)行了全面分析。結(jié)果表明，從甜瓜中鑒定出37個(gè)GRAS基因；這些基因在甜瓜的11條染色體上呈不均勻分布，并在6、7、8號(hào)染色體上出現(xiàn)串聯(lián)重復(fù)；甜瓜GRAS家族可分為HAM、LS、SCR、SCL3、DELLA、LISCL、SHR、PAT1 8個(gè)亞族；基因結(jié)構(gòu)分析顯示，含有1～3個(gè)內(nèi)含子的基因有8個(gè)，沒(méi)有內(nèi)含子的基因有29個(gè)；啟動(dòng)子分析，鑒定到生長(zhǎng)素、脫落酸、赤霉素、低溫、干旱、光信號(hào)響應(yīng)作用元件以及參與分生組織和胚乳表達(dá)的元件；表達(dá)模式分析結(jié)果表明，HAM、DELLA亞族的基因幾乎在所有組織中都有表達(dá)，LS亞族在根和莖中表達(dá)含量較高，PAT1亞族在甜瓜的整個(gè)生長(zhǎng)發(fā)育過(guò)程中發(fā)揮著重要作用。（剩余10823字）