基于滇黃精轉(zhuǎn)錄組序列的SSR標(biāo)記開發(fā)及其在黃精屬資源分析中的應(yīng)用

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摘要：本研究基于滇黃精轉(zhuǎn)錄組序列開發(fā)簡單重復(fù)序列（SSR）標(biāo)記并將其應(yīng)用于黃精屬資源分析。設(shè)計(jì)合成了45對(duì)SSR引物，經(jīng)PCR擴(kuò)增驗(yàn)證，選擇其中20對(duì)SSR引物對(duì)75份黃精屬資源進(jìn)行分析。結(jié)果表明，共在46 416個(gè)Unigene中檢出含有二核苷酸～六核苷酸重復(fù)類型的SSR位點(diǎn)60 238個(gè)，序列SSR發(fā)生頻率為22.78%，平均分布距離約7.07 kb；SSR位點(diǎn)中的主導(dǎo)類型是二核苷酸和三核苷酸重復(fù)，分別占50.06%和34.89%。（剩余15179字）