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基于網絡藥理學和分子對接技術探討芪藶強心膠囊治療慢性心力衰竭的作用機制

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〔摘要〕 目的 基于網絡藥理學和分子對接技術探討芪藶強心膠囊治療慢性心力衰竭的作用機制。方法 利用BATMAN-TCM平臺檢索芪藶強心膠囊的化學成分和靶點,通過GeneCards、OMIM、DisGeNET以及NCBI數(shù)據庫獲得慢性心力衰竭相關的靶點,利用PERL軟件將中藥和疾病的基因進行合并,得到交集基因,構建“中藥-疾病”靶點數(shù)據庫,利用Cytoscape 3.7.2繪制“中藥-疾病-有效成分-靶點”網絡圖,篩選出核心有效成分;利用STRING數(shù)據庫構建蛋白質相互作用(protein-protein interaction, PPI)網絡圖,篩選出核心靶點,利用Bioconductor數(shù)據庫和R版本4.0.4 (64 bit)軟件對靶點進行基因本體(gene ontology, GO)注釋描述和京都基因與基因組百科全書(Kyoto encyclopedia of genes and genomics, KEGG)富集分析,并通過Autodock軟件對核心有效成分以及靶點進行分子對接。(剩余12809字)

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