宏轉錄組測序技術在一起仔豬病毒性腹瀉疾病診斷中的運用及分析

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摘 要: 為了確定2023年春季廣西賀州地區(qū)豬場仔豬腹瀉病原,采用宏轉錄組測序技術篩查該地區(qū)豬群發(fā)病和感染情況,為當?shù)刈胸i腹瀉疾病的防控提供依據(jù)。(方法)采集2023年3月廣西賀州地區(qū)10 km范圍內6個相鄰并同時暴發(fā)腹瀉的豬場仔豬的肛拭子和糞便,運用MGISEQ 200測序平臺進行宏轉錄組測序開展豬病原感染組學研究,系統(tǒng)性地篩查該區(qū)域仔豬腹瀉的病原譜,使用實時熒光定量RT-PCR對最主要病毒進行確認,定量分析各病原的豐度并選取鑒定到的病毒基因序列進行系統(tǒng)發(fā)育分析,Pearson分析解析病原混合感染的相關性。(剩余21520字)