GC3(43.92%)>GC2(40.36%),密碼子末位堿基較偏好于A/U。確定了19個最優(yōu)密碼子,分別為GCA、GCU、GAU、UUU、GGA、GGU、CAU、AUU、CUU、AAU、CCA、CCU、CAA、UCA、UCU、ACA、ACU、GUU、UAU,其中以A結(jié)尾的有6個,以U結(jié)尾的有13個。葡萄基因組密碼子的使用受自然選擇和突變的雙重影響,其中導(dǎo)致葡萄基因組密碼子偏好性的主要因素為自然選擇。以上結(jié)果為葡萄基因組學(xué)的研究提供了理論基礎(chǔ),也為提高異源蛋白在葡萄中的表達(dá)和葡萄相關(guān)蛋白的體外表達(dá)提供了指導(dǎo)。-龍源期刊網(wǎng)" />

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葡萄基因組密碼子偏好性分析

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關(guān)鍵詞:葡萄;遺傳密碼;密碼子偏好性;自然選擇;突變壓力

葡萄(Vitis vinifera)是一種木質(zhì)藤本植物,屬于葡萄科葡萄屬。近年來,考古學(xué)家在中國地區(qū)的新石器時代遺址中發(fā)現(xiàn)了一些葡萄種子;《詩經(jīng)》中也有“六月食郁及薁”的記載;《本草綱目》和《神農(nóng)本草經(jīng)》更是記載著將葡萄的果實、莖葉、樹根作為藥物來治療一些疾病的方劑[1]。(剩余5533字)

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