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[摘要]目的篩選和鑒定胃癌預(yù)后相關(guān)的關(guān)鍵基因和通路,探討胃癌發(fā)生發(fā)展的機(jī)制。方法從基因表達(dá)數(shù)據(jù)庫中下載胃癌基因表達(dá)譜芯片數(shù)據(jù)集(GSE2685、GSE29272),通過在線分析工具GEO2R對(duì)胃癌組織和正常組織中的差異表達(dá)基因(DEGs)進(jìn)行篩選;通過基因功能注釋數(shù)據(jù)庫(DAVID)進(jìn)行功能富集分析;運(yùn)用交互基因檢索工具數(shù)據(jù)庫(STRING)和Cytoscape軟件分析DEGs可編碼蛋白之間的相互作用網(wǎng)絡(luò);利用在線生存分析數(shù)據(jù)庫(KM-plotter)分析核心候選基因和胃癌患者預(yù)后的相關(guān)性;通過免疫組化染色驗(yàn)證候選基因在胃癌組織中表達(dá)情況,并分析與胃癌臨床病理參數(shù)及預(yù)后的相關(guān)性;采用Cox風(fēng)險(xiǎn)回歸模型分析患者總體生存率的影響因素。(剩余11852字)
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胃癌預(yù)后相關(guān)基因的生物信息學(xué)鑒定
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