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單細(xì)胞測(cè)序結(jié)合機(jī)器學(xué)習(xí)算法揭示心力衰竭病人細(xì)胞間通訊及關(guān)鍵調(diào)控基因

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摘要  目的:基于單細(xì)胞測(cè)序和機(jī)器學(xué)習(xí)算法構(gòu)建心力衰竭(HF)的診斷模型,并探索HF病人中細(xì)胞間通訊。方法:使用Seurat包對(duì)單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序(scRNA-seq)數(shù)據(jù)質(zhì)控、降維、聚類(lèi)和注釋。通過(guò)AUCell評(píng)估各細(xì)胞亞群的免疫活性,選擇免疫活性最高的細(xì)胞亞群進(jìn)行后續(xù)分析。基于批量轉(zhuǎn)錄組測(cè)序(Bulk RNA-seq)數(shù)據(jù),使用limma包篩選差異表達(dá)基因并進(jìn)行基因集富集分析(GSEA)。(剩余16092字)

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