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基于網(wǎng)絡藥理學及分子對接探討益氣活血方治療冠心病的作用機制

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摘要 目的:通過網(wǎng)絡藥理學方法分析益氣活血方治療冠心病的分子作用機制,并通過分子對接進行驗證。方法:通過中藥系統(tǒng)藥理學數(shù)據(jù)庫與分析平臺(TCMSP)和中藥分子機制的生物信息學分析工具數(shù)據(jù)庫(BATMAN-TCM)進行檢索并篩選出益氣活血方中的藥物活性成分及作用靶點;在人類基因名片數(shù)據(jù)庫(GeneCards)、人類孟德爾遺傳在線數(shù)據(jù)庫(OMIM)、藥品數(shù)據(jù)與藥物靶點數(shù)據(jù)庫(DrugBank)、治療靶點數(shù)據(jù)庫(TTD)檢索冠心病對應疾病靶點;通過R語言“Venn”插件得到藥物有效活性成分和冠心病的共同靶點基因,應用STRING數(shù)據(jù)庫,獲得蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用(PPI)網(wǎng)絡圖,利用Cytoscape 3.7.2軟件中CytoNCA插件篩選候選核心靶點基因,并逆向獲得相關有效成分;共同靶點通過R語言“ClusterProfile”等插件,完成基因本體(GO)與京都基因與基因組百科全書(KEGG)富集分析;Cytoscape 3.7.2軟件繪制成分-靶點-通路,根據(jù)節(jié)點篩選核心靶點及成分;利用AutodockTool 4軟件對所篩選的核心靶點及成分進行分子對接。(剩余17580字)

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