基于甲基化捕獲聯(lián)合轉錄組測序探討梔子-川芎藥對抗動脈粥樣硬化的作用機制

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摘要目的：觀察梔子-川芎藥對對氧化型低密度脂蛋白（ox-LDL）誘導的RAW264.7泡沫細胞DNA甲基化和轉錄組表達的作用。方法：細胞毒性試驗（CCK-8）法檢測不同濃度梔子-川芎凍干粉對RAW 264.7細胞的增殖抑制情況；以ox-LDL處理RAW 264.7細胞48 h形成泡沫細胞，將細胞分為梔子-川芎凍干粉組（80 mg/L ox-LDL、0.3 g/L 梔子-川芎凍干粉干預）、模型組（80 mg/L ox-LDL處理）和空白對照組（未處理）；氣相、色譜質譜法（GC-MS）和酶聯(lián)免疫吸附法（ELISA）分別檢測各組總膽固醇（TC）、游離膽固醇（FC）以及炎性因子［腫瘤壞死因子α（TNF-α）、白介素6（IL-6）和細胞間黏附分子1（ICAM-1）］的表達；采用DNA甲基化捕獲測序（MC-seq）和轉錄組測序（RNA-seq）方法檢測各組細胞全基因組DNA甲基化和轉錄組基因表達水平，使用DSS工具分析各組樣本間的差異甲基化位點（DMS）和差異表達基因（DEGs），并利用生物信息學方法對差異基因進行京都基因與基因組百科全書（KEGG）和基因本體（GO）富集分析。（剩余15411字）