WGCNA聯(lián)合LASSO-COX方法篩選甲狀腺癌預(yù)后關(guān)鍵基因及其臨床價值分析

[摘要] 目的 篩選甲狀腺癌（thyroid cancer，THCA）的關(guān)鍵預(yù)后基因并構(gòu)建預(yù)后預(yù)測模型。方法 從癌癥基因組圖譜（The Cancer Genome Atlas，TCGA）數(shù)據(jù)庫中獲取THCA和正常樣本的基因表達譜，采用Limma算法篩選THCA組織與正常組織間差異表達基因（differentially expressed genes，DEGs），再進行權(quán)重基因共表達網(wǎng)絡(luò)分析（weighted gene co-expression network analysis，WGCNA）和套索聯(lián)合COX回歸分析（least absolute shrinkage and selection operator regression COX analysis，LASSO-COX）獲得與其預(yù)后相關(guān)基因，然后根據(jù)關(guān)鍵基因構(gòu)建預(yù)后預(yù)測模型，基于風(fēng)險評分進行生存分析和受試者工作特征（receiver operating characteristic，ROC）曲線分析，最后基于基因表達譜和風(fēng)險評分進行基因集富集分析（gene set enrichment analysis，GSEA）以評估相關(guān)途徑和分子機制。（剩余9739字）