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【摘要】 目的 利用生物信息學(xué)篩選阿爾茨海默?。ˋlzheimer’s disease,AD)海馬組織的差異表達(dá)基因(DEGs),分析DEGs的生物學(xué)功能和信號(hào)通路,為AD的診斷、治療靶點(diǎn)的篩選提供參考。方法 利用GEO(gene expression omnibus)數(shù)據(jù)庫(kù)下載基因芯片GSE48350、GSE5281,使用數(shù)據(jù)庫(kù)GEO2R工具在線分析,以P<0.05,|logFC>1|為條件篩選差異基因,篩選出與AD海馬組織相關(guān)的DEGs,通過(guò)制作維恩圖取交集獲得兩個(gè)芯片共同DEGs;使用R語(yǔ)言enrichGO函數(shù)對(duì)篩選出來(lái)的DEGs進(jìn)行基因本體論(GO)功能富集分析;在Metascape網(wǎng)站做京都基因與基因組百科全書(shū)(KEGG)通路分析;使用STRING數(shù)據(jù)庫(kù)和Cytoscape3.9.1軟件進(jìn)行蛋白-蛋白相互作用(PPI)網(wǎng)絡(luò)分析。(剩余10874字)
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基于生物信息學(xué)方法雙芯片聯(lián)合分析阿爾茨海默病海馬相關(guān)差異基因的研究
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