基于全基因組關(guān)聯(lián)分析和代謝組學(xué)篩選奶牛體細(xì)胞數(shù)性狀關(guān)鍵基因

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摘要：體細(xì)胞數(shù)性狀是奶牛生產(chǎn)及育種中的重要經(jīng)濟(jì)性狀之一，篩選該性狀相關(guān)的重要功能基因、挖掘關(guān)鍵分子標(biāo)記，對(duì)奶牛體細(xì)胞數(shù)性狀的遺傳改良具有重要意義。本研究通過(guò)全基因組關(guān)聯(lián)分析（GWAS）和代謝組學(xué)聯(lián)合分析篩選影響體細(xì)胞數(shù)性狀的重要基因及關(guān)鍵代謝物。首先，使用Illumina Bovine 50K SNP芯片鑒定2 709頭荷斯坦奶牛的基因型，利用奶牛體細(xì)胞數(shù)性狀的基因組估計(jì)育種值（genomic estimated breeding val-ue，GEBV）進(jìn)行GWAS，篩選到ⅣPFFR2、ZNF831、SLC4A4、SLM02、SKAP1和CBX1六個(gè)候選基因；KEGG通路分析發(fā)現(xiàn)，候選基因主要富集在神經(jīng)活性配體與受體的相互作用、胰腺分泌、膽汁分泌、近端小管碳酸氫鹽再生和Rapl倍號(hào)通路等生物過(guò)程。（剩余5800字）