木豆OFP蛋白基因家族鑒定與表達分析

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摘要:了解OFP卵型家族蛋白(OVATE family proteins)在木豆中的特征,為木豆OFP基因的應(yīng)用提供參考。利用生物信息學(xué)方法對木豆OFP蛋白基因進行全基因組鑒定及表達模式分析。結(jié)果表明,木豆含有21個OFP蛋白基因,家族成員間理化特性差異不大,均屬于不穩(wěn)定親水性蛋白,且均含有保守基序;進化樹分析中木豆和擬南芥二者的OFP蛋白相互交錯聚類在一起,親緣關(guān)系較近的OFP蛋白可能具有相似的功能;啟動子順式響應(yīng)元件分析表明木豆OFP基因可能在逆境脅迫響應(yīng)、激素調(diào)節(jié)和生長發(fā)育方面發(fā)揮重要作用;蛋白二級和三級結(jié)構(gòu)均以α-螺旋和無規(guī)則卷曲結(jié)構(gòu)為主要組成成分;組織特異性表達表明OFP基因在頂芽中的表達量較大,在根和葉中的表達量較小,具有組織表達差異;啟動子順式響應(yīng)元件結(jié)合熱脅迫表達分析表明,高溫脅迫下CcOFP1表達量上調(diào),CcOFP9、CcOFP11表達量下調(diào)。(剩余12497字)