蘇山豬和巴克夏豬全基因組ROH檢測和選擇信號分析

打開文本圖片集

摘  要： 旨在明確蘇山豬群體和巴克夏豬群體的遺傳變異位點(diǎn)和多態(tài)信息，本研究首先對43個(gè)蘇山豬樣本和21個(gè)巴克夏豬樣本進(jìn)行DNA提取，然后利用“中芯一號”50K SNP芯片對DNA的SNP位點(diǎn)進(jìn)行檢測；使用 Plink軟件對SNP 位點(diǎn)進(jìn)行主成分分析；使用 DetectRUNS 軟件包對樣本進(jìn)行全基因組ROH檢測；選用3種方法（ROH、CLR和iHS）對選擇信號進(jìn)行分析。（剩余19711字）