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基于Nanopore測(cè)序技術(shù)的非洲豬瘟病毒全基因組測(cè)序方法建立

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摘 要: 非洲豬瘟(ASF)是由非洲豬瘟病毒(ASFV)引起的一種高度傳染性和致死性疫病,近年來給我國(guó)生豬產(chǎn)業(yè)的健康發(fā)展造成了沉重打擊。ASFV龐大的基因組導(dǎo)致人們難以及時(shí)掌握流行毒株的全基因組序列。本研究旨在利用Nanopore三代測(cè)序技術(shù)建立一種簡(jiǎn)便可靠的ASFV全基因組測(cè)序方法。設(shè)計(jì)覆蓋ASFV全基因組的31對(duì)引物并分為4個(gè)引物池對(duì)樣本進(jìn)行擴(kuò)增,通過Nanopore測(cè)序技術(shù)對(duì)擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行測(cè)序,進(jìn)一步優(yōu)化相關(guān)生物信息學(xué)分析方法,最終成功建立了ASFV 全基因組測(cè)序方法。(剩余16447字)

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