一株牛源溶酪巨型球菌致病性及全基因組特征分析

打開文本圖片集

摘要：目的 本研究旨在研究1株牛源溶酪巨型球菌（Macrococcus caseolyticus，M. caseolyticus）的致病性和全基因組特征，挖掘該菌株的毒力和耐藥相關(guān)基因。方法 在新疆石河子市某牛場(chǎng)中采集1例病死牛肺臟，從牛肺臟灌洗液中分離鑒定了1株牛源溶酪巨型球菌，在此基礎(chǔ)上進(jìn)行了藥敏試驗(yàn)、動(dòng)物感染試驗(yàn)；并通過(guò)Illumina的二代測(cè)序技術(shù)對(duì)該菌株進(jìn)行全基因組框架圖構(gòu)建，構(gòu)建多個(gè)管家基因同源進(jìn)化樹，對(duì)編碼基因、重復(fù)序列、非編碼RNA等進(jìn)行預(yù)測(cè)，并在GO、KEGG、COG、NR和CAZy數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)基因組的基本功能特征進(jìn)行注釋，結(jié)合NR數(shù)據(jù)庫(kù)的注釋和PHI、CARD數(shù)據(jù)庫(kù)注釋，明確其基因組中毒力因子、耐藥性等相關(guān)基因。（剩余20992字）