基于全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的中國(guó)圓田螺微衛(wèi)星特征分析與標(biāo)記篩選

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摘要:通過高通量測(cè)序開發(fā)中國(guó)圓田螺多態(tài)性SSR標(biāo)記,為田螺的種質(zhì)利用及良種選育提供技術(shù)支撐。基于PacBio’s SMRT測(cè)序獲得中國(guó)圓田螺全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),查找基因組微衛(wèi)星(SSR)位點(diǎn)并分析其特征,共識(shí)別到8 058個(gè)SSR位點(diǎn),1~6個(gè)核苷酸重復(fù)SSR均存在,其中二核苷酸重復(fù)SSR數(shù)量最多(4 647,57.67%),其次為三核苷酸重復(fù)SSR(1 274,15.81%)。(剩余18815字)